Penggolongan utama kehidupan
| Domain | |
| Woese dan kawan-kawan menggunakan kajian rRNA untuk mengelompokkan seluruh organisme ke dalam tiga domain | |
| 1 | Bakteri – meliputi sebagian besar prokariot; dinding sel mengandung asam muramik; lipid membran mengandung asam lemak rantai lurus yang diikatkan oleh ikatan ESTER |
| 2 | Archaea – prokariot yang kekurangan asam muramik, mempunyai lipid yang mengandung rantai alifatik bercabang yang dihubungkan oleh ikatan ETER, kekurangan timidin pada tangan T molekul tRNA, mempunyai RNA polimerase jelas (distinctive), dan mempunyai ribosom dengan komposisi dan bentuk berbeda dengan yang terdapat di bakteri |
| 3 | Eukaria – mempunyai yang struktur organ yang dilapisi oleh membran yang lebih kompleks |
| Beberapa pohon filogenetik berbeda telah diusulkan yang menghubungkan domain utama; beberapa pohon yang diusulkan tidak medukung pola tiga domain. | |
| Salah satu kesulitan dalam mengkonstruksi suatu pohon filogenetik adalah transfer gen horisontal yang sering terjadi secara luas; pohon yang lebih benar, mungkin menyerupai jejaring dengan banyak percabangan lateral yang menghubungan bermacam-macam anak cabang (trunks) | |
| Kingdom | |
| Sistem lima kingdom yang diusulkan oleh Whittaker, yang pada awal diterima secara luas, adalah: | |
| 1 | Hewan-eukariot multiseluer dan tidak berdinding sel dan nutrisi ingestive |
| 2 | Tumbuhan-eukariot multiseluler berdinding sel dan nutrisi fotoautotropik (photoautotrophic nutrition) |
| 3 | Jamur (Fungi)-eukariot multiseluler dan uniseluler berdinding sel dan nutrisi absorptif (absorptive nutrition) |
| 4 | Protista-eukariot uniseluler dengan bermacam-macam mekanisme nutrisi |
| 5 | Monera (Prokariot)-seluruh organisme prokariotik |
| Banyak ahli biologi tidak menerima sistem Whittaker system, terutama disebabkan sistem tersebut tidak membedakan bakteri dan archaea | |
| Beberapa sistem alternatif telah disarankan, seperti sistem enam kingdom dan dua kerajaan (empire), delapan kingdom | |
